為改善三爺溪排水水質，臺南市長黃偉哲爭取經費，獲環保署核定約七點八億元辦理「三爺溪上游排水截流及虎尾寮水資源回收中心擴建工程」，可望有效削減上游排水污染負荷，使三爺溪重現水清、魚現風貌。

　水利局表示，三爺溪排水屬二仁溪支流，以上游網寮橋河段污染最嚴重，推測主污染源為生活污水與事業廢水，核定的二千九百萬元完成網寮橋上游大灣排水截流及虎尾寮水資源回收中心功能提升工程設計，今年再獲環保署經費，透過截流網寮橋上游晴天污水至虎尾寮水資中心處理，減少三爺溪污染負荷。

　水利局指出，為加強改善三爺溪上游河段水質，規劃將水資中心放流水回送至上游網寮橋河段益補乾淨水源，削減率可達八成以上，渴望由嚴重污染降至中度污染以下，使三爺溪重現水清魚現風貌。