桃園機場在九月一日新冠肺炎核酸檢測採檢從原來的咽喉拭子改為深喉唾液採檢，受檢者只要清出咽喉處唾液並吐在檢體盒中即可，民眾免受插喉痛苦。中央流行疫情指揮中心發言人莊人祥表示，以前做咽喉拭子需要一名醫師搭配一名護理人員，然而深喉唾液採檢的表現不輸於咽喉拭子，且可減少醫療人力需求，只需要有人在旁看檢測流程是否有做確實。

桃園國際機場於七月二日至八月廿四日期間，對一二二六位旅客同時採集「深喉唾液」與「咽喉拭子」檢體及送實驗室進行核酸檢測，其中深喉唾液與咽喉拭子檢體皆陽性計十二人、深喉唾液為陽性但咽喉拭子為陰性計八人、深喉唾液為陰性但咽喉拭子為陽性計四人、兩者皆陰性計一二○二人；經分析統計兩者檢驗結果一致性高（Kappa值○‧六六）。由於未定義黃金標準，故不特別計算敏感性。

指揮中心說明，機場入境旅客「深喉唾液」採檢陰性的旅客，於入境檢疫十四天期間，若症狀未改善或持續，依現行作業將被通報及再次採檢，不會影響防疫安全。