臺鐵局為增進斗南站及鄰近地區旅客搭車方便性，於一○六年十二月開始，進行跨站式站房新建工程，歷經二年九個月，第一階段新站房訂於本（九）月五日啟用，站內新設有無障礙電梯四座及電扶梯六座等服務設施，並可由鐵路東、西兩側進出車站，為附近民眾帶來更便利的搭車環境。

為慶祝斗南站跨站式站房啟用紀念，臺鐵局將於啟用典禮當日上午九時三十分起，在斗南舊站候車室發售一千套紀念套票，每套售價新台幣二百元整（每人限購五套），現場並備有新站啟用紀念戳章，歡迎喜愛鐵道民眾購買珍藏。